在UASB反應器內，厭氧污泥可以以絮狀的聚集體(絮狀污泥) 存在，也可以以直徑約 0.5~0.6mm 的球形或橢球形(顆粒污泥)存在。在厭氧反應器內顆粒污泥形成的過程稱之為顆粒污泥化，顆粒污泥化是大多數 UASB 反應器啟動的目標和啟動成功的標志。

顆粒污泥的形成使 UASB 內可以保留高濃度的厭氧污泥。這首先是因為顆粒污泥具有極好的沉降性能。絮狀污泥沉降性能較差，當產氣量較高、廢水上流速度略高時，絮狀污泥則容易沖洗出反應器。產與水流的剪切力也易于使絮狀污泥進一步分散，這加劇了絮狀污泥的洗出，而顆粒污泥有極好的沉降性能，它能在很高的產氣量和高上流速度下保留在厭氧反應器內。因此，污泥的顆粒化可以使 UASB 反應器允許有更高的有機物容積負荷和水力負荷。

由于厭氧微生物，特別是甲烷菌增殖很慢，厭氧反應器的啟動需要較長的時間，這被認為是高速厭氧反應器的一個不足之處。但是，一旦初次啟動完成，在停止運行后的再次啟動可以迅速完成。當使用現有廢水處理系統的厭氧顆粒污泥啟動時，它要比其他任何高速厭氧反應器的啟動都要快得多。

——洗出的污泥不再返回反應器；

——當進液 COD濃度大于5000mg/L 時采用出水循環或稀釋進液；

——逐步增加有機負荷，有機負荷的增加應當在可降解 COD 能被去除 80% 后再進行；

——保持乙酸濃度始終低于1000mg/L；

——低濃度的廢水有利于顆粒化的快速形成，但濃度也應當足夠維持良好的細菌生產條件，最小的COD 濃度應為1000mg/L；

——過量的懸浮物會阻礙顆粒化的形成；

——溶解性碳水化合物為主要底物的廢水比以 VEA 為主的廢水顆粒化過程快，當廢水含有蛋白質時應使蛋白質盡可能降解；

——在中溫范圍，最佳溫度為38C ~40C，高溫范圍為50C ~60C；

——在反應器內的 pH 應始終保持在 6.2以上；

——營養物質和微量元素應當滿足微生物生長的需要。

——毒性化合物應當低于抑止濃度或給予污泥足夠的馴化和時間。